Marine Guyot · ingénieure logiciel de rechercheÀ propos

Marine Guyot

J'ai commencé sur les véhicules autonomes, je me suis tournée vers l'ingénierie biomédicale, puis j'ai passé trois ans dans un labo de neurosciences à construire des logiciels qui devaient fonctionner en temps réel, pendant l'expérience elle-même. Depuis 2023, je suis ingénieure logiciel de recherche freelance, auprès de labos et de jeunes sociétés en neurosciences, en biotech, en imagerie et en apprentissage automatique.

Je suis souvent la personne entre les deux : je comprends ce que les chercheurs veulent montrer, et ce qu'il faut pour que le logiciel tienne. Pour avoir travaillé dans de nombreux labos, je reconnais les mêmes problèmes sous des vocabulaires différents : versions divergentes, code que plus personne ne porte, résultats difficiles à reproduire.

J'utilise des assistants d'IA dans mon travail, avec la confidentialité comme priorité : Claude seulement quand le client est d'accord et que c'est pertinent pour ce qu'on développe, des modèles locaux sinon, pour que votre code et vos données ne partent vers aucun service tiers.

Parcours

• 2023 → aujourd'huiIngénieure logiciel de recherche freelance, CodingResearcher. Des labos en Suisse, en Belgique et en France, et des spinoffs. Cas clients
• 3 ansEnseignement : cours d'Arduino et de systèmes embarqués pour des étudiants de niveau master, à l'ESME et à la CSB School. Ateliers
• 2019 → 2023Ingénieure logiciel, labo Kloosterman, NERF / imec, Louvain. Neurosciences en boucle fermée et en temps réel (Falcon, Open Ephys, Neuropixels), outils d'analyse, intégration continue.
• 2018 → 2019Études post-master en ingénierie biomédicale, KU Leuven. Traitement du signal, biologie cellulaire, physiologie ; une application MATLAB avec la spin-off VIPUN Medical.
• 2017 → 2018Ingénieure algorithmes, Alten Technology, Troy, Michigan.
• 2014 → 2017Ingénieure de recherche en alternance, Groupe PSA, Recherche & Innovation. Architecture logicielle et matérielle d'une plateforme robotique pour valider des algorithmes de véhicules autonomes.
• 2012 → 2017Diplôme d'ingénieure en systèmes embarqués, Esisar, Grenoble INP. Prix « Student of the Year 2015 » décerné par EDF.

Open source

• Falcon : décodage neuronal en temps réel (sous-système des nœuds de traitement, système de build, plugins)
• Open Ephys : le plugin falcon-output et un travail sur la prise en charge du Neuropixels PXI
• SpikeInterface : contributions et hackathon 2022
• Dropboxdrivefs (organisation fsspec) : mainteneuse principale

Publication

“Protocol for closed-loop optogenetic manipulation of cortical activity following hippocampal sharp-wave ripples in freely behaving rats”, STAR Protocols, 2025.

Langues

Français et anglais. En dehors du travail, je suis sapeuse-pompière volontaire.

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